防水涂料最大的优势是施工方便，对基层要求低，卷材无法施工的区域，例如太窄、空间太矮等，防水涂料都可以完美解决。防水涂料的施工过程中，现场管理显得十分重要，涂料防水由于其取材较易，部份防水材料的生产设备相对较简单，包装、调配可有隋意性，因此容易出现偷工减料、粗制滥造的情况。
然而涂料防水层厚度不象卷材那样直观、均匀和可控性，它的厚度是根据施工时的涂布遍数决定的。
卷材防水的优点如：施工方便、工期短、成形后不须养护、不受气温影响、环境污染小，层厚容易按设防计要求撑握，用材计算准确、施工的现场管理方便，不易被偷工减料，层厚均匀，空铺时能有效地克服基层应力（在基层发生效大裂缝时能保持防水层整体）。卷材防水究其弊端如：防水卷材在防水施工中当根据防水基层的形状而进行量体截衣，对于外形复杂的基层需多块拼接，防水卷材相互搭接处的粘结难度较大，由于多块拼接影响防水层的美观；再则完全绝对的密封将成为主要难题，漏水隐患最大、机会最多的就是卷材的搭接部位；再则防水卷材在施工后的保护和漏水后的维修亦是难题，裸露在外的防水层对外来的机械性损伤的预防十分重要，防水卷材与基层的粘结无论是满铺、点铺、条铺、空铺，卷材与基层之间都将是走水层，不管任何部位的贯穿性破损，脱胶、漏胶（那怕是只有一处），整个与其相连贯层面的防水功能都将全部衰失，如果不能找到破损和缺陷部位，则局部的修补就不可能，那么只有重做防水层。
防水涂料和防水卷材的区别主要产生于生产原材料、工艺等原因，两者的特性、施工工艺、应用环境由这些差异产生不同。两者各有利弊，在选择的时候只要按照自己的需求来选择最适合的防水卷材或者防水涂料。
防水涂料优点——无视基面复杂问题可做成连续整体的防水层；设备简单，施工技术容易掌握；大面积施工工期短，施工强度低；涂料防水层与基层具有100%的粘结面(裂缝、节点等部位使用加强层空铺法除外)；涂料防水层在可使用年限内的漏水，大多为基层开裂宽度超过防水涂层的可延伸幅度，漏水原因和形成漏水的部位极易发现，保修非常方便，只要少量防水材料修补裂缝和损伤部位即可；高品质的防水涂料可在背水面防水获得成功。
部分防水涂料可在潮湿基层施工并形成防水层。缺点——部分防水涂料需一定时间的物理和化学反应固结后才能生成防水层；部份防水涂料在固化过程中产生有害气体释放，对人体有害。有的防水涂料一个防水层的完工需要多遍涂刷，每遍涂刷要有一定的间隔时间，因此防水层的最后完成要较长时间；防水涂料的施工过程中，现场管理显得十分重要，偷工减料、粗制滥造在管理疏忽的情况下将会有机可乘；涂料防水层厚度是根据施工时的涂布遍数决定的，除了涂布遍数外，涂料本身的固含量是成膜厚度决定因素。防水卷材优点——防水卷材施工成形后无须养护;施工厚度按设计很容易计算，材料用量计算准确;施工现场管理方便，不易偷工减料;层厚均匀；空铺时能有效地克服基层应力。
缺点——防水卷材应付复杂的基层只能使用拼接的方式，相互搭接难度大，接口防水质量无法保障，漏水隐患大；防水卷材任何部位的贯穿性破损，脱胶、漏胶(那怕是只有一处)，整个与其相连贯层面的防水功能都将全部衰失，如果不能找到破损和缺陷部位，则局部修补就不可能，那么只有重做防水；防水卷材施工强度大，对施工人员的实际施工能力要求高；大面积防水工程施工工期长。可见，防水卷材和防水涂料各有所长，各有所短，但是相对于防水卷材的缺点，防水涂料的缺点是技术进步和材料选择可以解决的，选择一款好的防水涂料，上述的缺点全不存在，只需要加强防水施工现场管理即可。
防水卷材防水涂料与防水卷材的优点：防水涂料：施工简单、施工技术容易掌握、大面积施工工期短、施工强度低。防水卷材：施工成型后无需养护、施工厚度容易计算、材料用量计算准确、层厚均匀不易偷工减料。
防水涂料与防水卷材的缺点：防水涂料：部分的防水涂料需一定时间物理和化学反应固定后才能生成防水层，时间久、释放对人体有害的气体、需要多次涂刷等。
者的ji防水卷材：对付复杂的基层只能用拼接方式，接口无法保证防水质量、施工强度大、对施工者的技术有要求等等。
